Babak gugur Piala Thomas 2020 adalah babak kedua dan terakhir dari putaran final Piala Thomas 2020, yang diselenggarakan bersamaan dengan Piala Uber 2020, dalam rangkaian Piala Thomas dan Uber 2020. Babak ini menggunakan sistem gugur dengan terdiri atas babak perempat final, semifinal, dan pertandingan final. Indonesia meraih Piala Thomas edisi ini setelah mengalahkan Tiongkok pada pertandingan final. Tuan rumah Denmark dan Jepang sama-sama kalah dalam pertandingan semifinal.

Dua tim terbaik dari masing-masing grup berhak lolos ke babak ini.

Grup	Juara	Peringkat kedua
Grup A	Indonesia	Thailand
Grup B	Denmark	Korea Selatan
Grup C	Tiongkok	India
Grup D	Jepang	Malaysia

Pengundian dilakukan pada 14 Oktober 2021, setelah pertandingan terakhir dalam babak grup.

	Perempat final				Semifinal				Final
	15 Oktober – Aarhus
	Indonesia	3
					16 Oktober – Aarhus
	Malaysia	0
					Indonesia	3
	15 Oktober – Aarhus
					Denmark	1
	Denmark	3
									17 Oktober – Aarhus
	India	1
									Indonesia	3
	15 Oktober – Aarhus
									Tiongkok	0
	Thailand	0
					16 Oktober – Aarhus
	Tiongkok	3
					Tiongkok	3
	15 Oktober – Aarhus
					Jepang	1
	Korea Selatan	2
	Jepang	3

Thailand  v  Tiongkok

15 Oktober 2021 (2021-10-15) 8.30 UTC+2

Thailand	0–3	Tiongkok
	Laporan

Ceres Arena Lapangan 2, Aarhus

Rincian
1 2 3 1 Kantaphon Wangcharoen Shi Yuqi 14 21 17 21     2 Supak Jomkoh / Kittinupong Kedren He Jiting / Zhou Haodong 10 21 18 21     3 Kunlavut Vitidsarn Li Shifeng 13 21 21 17 7 21   4 Dechapol Puavaranukroh / Nanthakarn Yordphaisong Liu Cheng / Wang Yilyu       tidak dimainkan 5 Adulrach Namkul Weng Hongyang       tidak dimainkan

Korea Selatan  v  Jepang

15 Oktober 2021 (2021-10-15) 8.30 UTC+2

Korea Selatan	2–3	Jepang
	Laporan

Ceres Arena Lapangan 1, Aarhus

Rincian
1 2 3 1 Heo Kwang-hee Kento Momota 21 19 21 17     2 Choi Sol-gyu / Seo Seung-jae Takuro Hoki / Yugo Kobayashi 21 18 21 13     3 Jeon Hyeok-jin Kanta Tsuneyama 10 21 16 21     4 Kang Min-hyuk / Kim Won-ho Akira Koga / Yuta Watanabe 15 21 18 21     5 Cho Geon-yeop Kenta Nishimoto 15 21 10 21

Indonesia  v  Malaysia

15 Oktober 2021 (2021-10-15) 13.30 UTC+2

Indonesia	3–0	Malaysia
	Laporan

Ceres Arena Lapangan 2, Aarhus

Rincian
1 2 3 1 Anthony Sinisuka Ginting Lee Zii Jia 21 15 21 17     2 Marcus Fernaldi Gideon / Kevin Sanjaya Sukamuljo Aaron Chia / Soh Wooi Yik 21 17 16 21 21 15   3 Jonatan Christie Ng Tze Yong 14 21 21 19 21 16   4 Fajar Alfian / Muhammad Rian Ardianto Goh Sze Fei / Nur Izzuddin Mohd Rumsani       tidak dimainkan 5 Shesar Hiren Rhustavito Leong Jun Hao       tidak dimainkan

Denmark  v  India

15 Oktober 2021 (2021-10-15) 13.30 UTC+2

Denmark	3–1	India
	Laporan

Ceres Arena Lapangan 1, Aarhus

Rincian
1 2 3 1 Viktor Axelsen Srikanth Kidambi 21 12 21 13     2 Kim Astrup / Anders Skaarup Rasmussen Satwiksairaj Rankireddy / Chirag Shetty 15 21 21 17 18 21   3 Anders Antonsen B. Sai Praneeth 21 8 21 15     4 Mathias Christiansen / Frederik Søgaard Arjun M.R. / Dhruv Kapila 21 16 21 9     5 Rasmus Gemke Sameer Verma       tidak dimainkan

Indonesia  v  Denmark

16 Oktober 2021 (2021-10-16) 13.00 UTC+2

Indonesia	3–1	Denmark
	Laporan

Ceres Arena Lapangan 1, Aarhus

Rincian
1 2 3 1 Anthony Sinisuka Ginting Viktor Axelsen 9 21 15 21     2 Marcus Fernaldi Gideon / Kevin Sanjaya Sukamuljo Kim Astrup / Anders Skaarup Rasmussen 21 13 10 21 21 15   3 Jonatan Christie Anders Antonsen 25 23 15 21 21 16   4 Fajar Alfian / Muhammad Rian Ardianto Mathias Christiansen / Frederik Søgaard 21 14 21 14     5 Shesar Hiren Rhustavito Hans-Kristian Vittinghus       tidak dimainkan

Tiongkok  v  Jepang

16 Oktober 2021 (2021-10-16) 13.00 UTC+2

Tiongkok	3–1	Jepang
	Laporan

Ceres Arena Lapangan 2, Aarhus

Rincian
1 2 3 1 Shi Yuqi Kento Momota 20 22 5 20   mundur   2 He Jiting / Zhou Haodong Takuro Hoki / Yuta Watanabe 21 17 7 21 21 16   3 Li Shifeng Kanta Tsuneyama 21 17 21 15     4 Liu Cheng / Wang Yilyu Akira Koga / Taichi Saito 21 11 22 20     5 Weng Hongyang Kenta Nishimoto       tidak dimainkan

Indonesia  v  Tiongkok

17 Oktober 2021 (2021-10-17) 13.00 UTC+2

Indonesia	3–0	Tiongkok
	Laporan

Ceres Arena Lapangan 1, Aarhus

Rincian
1 2 3 1 Anthony Sinisuka Ginting Lu Guangzu 18 21 21 14 21 16   2 Fajar Alfian / Muhammad Rian Ardianto He Jiting / Zhou Haodong 21 12 21 19     3 Jonatan Christie Li Shifeng 21 14 18 21 21 14   4 Daniel Marthin / Kevin Sanjaya Sukamuljo Liu Cheng / Wang Yilyu       tidak dimainkan 5 Shesar Hiren Rhustavito Weng Hongyang       tidak dimainkan