Babak grup Liga Champions UEFA 2003–2004 berlangsung antara 16 September dan 10 Desember 2003. Babak grup menampilkan tim-tim yang lolos berdasarkan posisi liga mereka dan tim-tim lain yang lolos dari kualifikasi.

Ke-32 tim tersebut dibagi ke dalam empat pot.^[1] Pot 1 terdiri dari pemegang gelar tahun sebelumnya Milan dan tujuh klub teratas dalam peringkat tim. Pot 2 berisi delapan klub berikut dalam peringkatnya dan begitu pula untuk Pot 3 dan 4. Setiap grup berisi satu tim dari setiap pot. Unggulan tim ditentukan oleh Koefisien UEFA.^[2]

Klub dari asosiasi yang sama dipasangkan untuk membagi hari pertandingan antara Selasa dan Rabu. Klub dengan surat pasangan yang sama akan bermain pada hari yang berbeda, memastikan bahwa tim dari kota yang sama (misalnya Milan dan Inter Milan, yang juga berbagi stadion) tidak bermain di hari yang sama.

Pemenang grup dan runner-up melaju ke babak gugur

Tim peringkat ketiga mengikuti Piala UEFA di babak gugur

Pot 1 Tim Koef. MilanTH 97.155 Real Madrid 151.769 Manchester United 136.170 Bayern Munich 124.566 Lazio 106.155 Arsenal 105.170 Juventus 100.155 Deportivo La Coruña 98.769

Pot 2 Tim Koef. Inter Milan 93.155 Porto 86.791 Celta Vigo 86.769 Galatasaray 78.495 Lyon 76.734 Panathinaikos 72.391 Chelsea 70.170 PSV Eindhoven 60.749

Pot 3 Tim Koef. Celtic 57.187 AEK Athens 56.391 Dynamo Kyiv 55.291 Ajax 54.749 Olympiacos 54.391 Rangers 50.187 Sparta Prague 49.975 Marseille 49.734

Pot 4 Tim Koef. Stuttgart 49.566 Lokomotiv Moscow 49.520 Anderlecht 49.250 Real Sociedad 47.769 Monaco 45.734 Club Brugge 44.250 Beşiktaş 33.495 Partizan 20.915

Selama babak penyisihan grup, masing-masing tim akan menghadapi tiga tim lainnya di grupnya sebanyak dua kali (kandang dan tandang atau di tempat alternatif). Dua tim teratas dengan poin terbanyak atau yang memenuhi kriteria tie-break maju ke babak gugur. Tim peringkat ketiga memasuki Piala UEFA pada tahun 2004.

Berdasarkan paragraf 4.05 peraturan UEFA untuk musim saat ini, jika dua tim atau lebih memiliki poin yang sama setelah menyelesaikan pertandingan grup, kriteria berikut diterapkan untuk menentukan peringkat:

1. jumlah poin yang diperoleh dalam pertandingan grup yang dimainkan di antara tim-tim yang bersangkutan;
2. selisih gol dari pertandingan grup yang dimainkan di antara tim-tim yang bersangkutan;
3. jumlah gol tandang dalam pertandingan grup yang dimainkan di antara tim-tim yang bersangkutan;
4. selisih gol dari semua pertandingan grup yang dimainkan;
5. jumlah gol di semua pertandingan grup yang dimainkan;
6. jumlah poin koefisien yang dikumpulkan oleh klub yang bersangkutan, serta asosiasinya, selama lima musim sebelumnya.

Waktunya adalah CET/CEST,^{[N 1]} seperti yang tercantum oleh UEFA (waktu setempat ada dalam tanda kurung).

Pos	Tim	Main	M	S	K	MG	KG	SG	Poin	Kualifikasi		OL	BAY	CEL	AND
1	Lyon	6	3	1	2	7	7	0	10	Maju ke babak gugur		—	1–1	3–2	1–0
2	Bayern Munich	6	2	3	1	6	5	+1	9			1–2	—	2–1	1–0
3	Celtic	6	2	1	3	8	7	+1	7	Transfer ke Piala UEFA		2–0	0–0	—	3–1
4	Anderlecht	6	2	1	3	4	6	−2	7			1–0	1–1	1–0	—

---

---

---

---

---

Pos	Tim	Main	M	S	K	MG	KG	SG	Poin	Kualifikasi		ARS	LM	INT	DK
1	Arsenal	6	3	1	2	9	6	+3	10	Maju ke babak gugur		—	2–0	0–3	1–0
2	Lokomotiv Moscow	6	2	2	2	7	7	0	8			0–0	—	3–0	3–2
3	Inter Milan	6	2	2	2	8	11	−3	8	Transfer ke Piala UEFA		1–5	1–1	—	2–1
4	Dynamo Kyiv	6	2	1	3	8	8	0	7			2–1	2–0	1–1	—

---

---

---

---

---

Pos	Tim	Main	M	S	K	MG	KG	SG	Poin	Kualifikasi		MON	DEP	PSV	AEK
1	Monaco	6	3	2	1	15	6	+9	11	Maju ke babak gugur		—	8–3	1–1	4–0
2	Deportivo La Coruña	6	3	1	2	12	12	0	10			1–0	—	2–0	3–0
3	PSV Eindhoven	6	3	1	2	8	7	+1	10	Transfer ke Piala UEFA		1–2	3–2	—	2–0
4	AEK Athens	6	0	2	4	1	11	−10	2			0–0	1–1	0–1	—

---

---

---

---

---

Pos	Tim	Main	M	S	K	MG	KG	SG	Poin	Kualifikasi		JUV	RSO	GAL	OLY
1	Juventus	6	4	1	1	15	6	+9	13	Maju ke babak gugur		—	4–2	2–1	7–0
2	Real Sociedad	6	2	3	1	8	8	0	9			0–0	—	1–1	1–0
3	Galatasaray	6	2	1	3	6	8	−2	7	Transfer ke Piala UEFA		2–0	1–2	—	1–0
4	Olympiacos	6	1	1	4	6	13	−7	4			1–2	2–2	3–0	—

---

---

---

---

(*) awalnya dijadwalkan pada tanggal 25 November, namun ditunda karena alasan keamanan karena Pemboman teroris Istanbul tanggal 15 dan 20 November

---

Pos	Tim	Main	M	S	K	MG	KG	SG	Poin	Kualifikasi		MU	STU	PAN	RAN
1	Manchester United	6	5	0	1	13	2	+11	15	Maju ke babak gugur		—	2–0	5–0	3–0
2	Stuttgart	6	4	0	2	9	6	+3	12			2–1	—	2–0	1–0
3	Panathinaikos	6	1	1	4	5	13	−8	4	Transfer ke Piala UEFA		0–1	1–3	—	1–1
4	Rangers	6	1	1	4	4	10	−6	4			0–1	2–1	1–3	—

---

---

---

---

---

Pos	Tim	Main	M	S	K	MG	KG	SG	Poin	Kualifikasi		RM	POR	OM	PAR
1	Real Madrid	6	4	2	0	11	5	+6	14	Maju ke babak gugur		—	1–1	4–2	1–0
2	Porto	6	3	2	1	9	8	+1	11			1–3	—	1–0	2–1
3	Marseille	6	1	1	4	9	11	−2	4	Transfer ke Piala UEFA		1–2	2–3	—	3–0
4	Partizan	6	0	3	3	3	8	−5	3			0–0	1–1	1–1	—

---

---

---

---

---

Pos	Tim	Main	M	S	K	MG	KG	SG	Poin	Kualifikasi		CHE	SP	BJK	LAZ
1	Chelsea	6	4	1	1	9	3	+6	13	Maju ke babak gugur		—	0–0	0–2	2–1
2	Sparta Prague	6	2	2	2	5	5	0	8			0–1	—	2–1	1–0
3	Beşiktaş	6	2	1	3	5	7	−2	7	Transfer ke Piala UEFA		0–2	1–0	—	0–2
4	Lazio	6	1	2	3	6	10	−4	5			0–4	2–2	1–1	—

---

---

---

---

---

Pos	Tim	Main	M	S	K	MG	KG	SG	Poin	Kualifikasi		MIL	CEL	BRU	AJA
1	Milan	6	3	1	2	4	3	+1	10	Maju ke babak gugur		—	1–2	0–1	1–0
2	Celta Vigo	6	2	3	1	7	6	+1	9			0–0	—	1–1	3–2
3	Club Brugge	6	2	2	2	5	6	−1	8	Transfer ke Piala UEFA		0–1	1–1	—	2–1
4	Ajax	6	2	0	4	6	7	−1	6			0–1	1–0	2–0	—

---

---

---

---

---