Analog substrat
Analog substrat atau analog keadaan substrat adalah senyawa kimia dengan struktur kimia yang menyerupai molekul substrat dalam reaksi kimia yang dikatalisis enzim. Analog substrat dapat bertindak sebagai penghambat kompetitif dari reaksi enzimatik. Contohnya adalah fosforamidat terhadap ribozim kelompok I Tetrahymena.[1] Contoh lain dari analog substrat termasuk 5'-adenilil-imidodifosfat, analog substrat ATP, dan 3-asetilpiridina adenina dinukleotida, analog substrat NADH.[2]
Sebagai penghambat kompetitif, analog substrat menempati situs pengikatan yang sama dengan analognya, dan mengurangi efisiensi substrat yang dituju.[3] Laju maksimum (Vmax) tetap sama,[4] sementara afinitas substrat yang dituju (diukur dengan konstanta Michaelis [KM]) menurun.[5] Ini berarti bahwa lebih sedikit substrat yang dituju akan berikatan dengan enzim, sehingga menghasilkan lebih sedikit produk yang terbentuk. Selain itu, analog substrat mungkin juga kekurangan komponen kimia yang memungkinkan enzim untuk melanjutkan reaksinya. Hal ini juga menyebabkan jumlah produk yang dihasilkan menurun.
Analog substrat biasanya berikatan dengan situs pengikatan secara reversibel, yang berarti bahwa pengikatan analog substrat ke situs pengikatan enzim tidak permanen. Efek analog substrat dapat dinetralkan dengan meningkatkan konsentrasi substrat yang semula dituju.[6] Ada juga analog substrat yang berikatan dengan situs pengikatan enzim secara ireversibel. Jika demikian, analog substrat disebut "analog substrat penghambat", "substrat bunuh diri", atau "substrat kuda Troya".[7] Contoh analog substrat yang juga merupakan substrat bunuh diri/substrat kuda Troya adalah penisilin, yang merupakan analog substrat penghambat peptidoglikan.[8]
Beberapa analog substrat masih memungkinkan enzim untuk mensintesis produk meskipun enzim tidak mampu memetabolisme analog substrat tersebut. Analog substrat ini dikenal sebagai penginduksi gratuitous.[9] Contoh analog substrat yang juga merupakan penginduksi gratuitous adalah IPTG (isopropil β-D-1-tiogalaktopiranosida), analog substrat dan penginduksi gratuitous aktivitas beta-galaktosidase.[10]
Lihat juga
- Enzim
- Penghambat enzim
- Analog struktur, senyawa kimia dengan struktur serupa
Referensi
- ^ Hanna, Raven L.; Gryaznov, Sergei M.; Doudna, Jennifer A. (2000-11-01). "A phosphoramidate substrate analog is a competitive inhibitor of the Tetrahymena group I ribozyme". Chemistry & Biology (dalam bahasa Inggris). 7 (11): 845–854. doi:10.1016/S1074-5521(00)00033-8. ISSN 1074-5521. PMID 11094338.
- ^ Stein, Ross L. Kinetics of Enzyme Action: Essential Principles for Drug Hunters. Hoboken, NJ: John Wiley, 2011. Print. p185. ISBN 9780470414118
- ^ Garrett, Reginald H.; Grisham, Charles M. (2013). Biochemistry (5th ed. ed.). Belmont, CA: Brooks/Cole, Cengage Learning. p. 108. ISBN 9781133106296
- ^ Garrett, Reginald H.; Grisham, Charles M. (2013). Biochemistry (5th ed. ed.). Belmont, CA: Brooks/Cole, Cengage Learning. p. 108. ISBN 9781133106296
- ^ Cannon, Joseph G. Pharmacology for Chemists. Oxford: Oxford UP, 2007. Print. p70. ISBN 9780841239272
- ^ Cannon, Joseph G. Pharmacology for Chemists. Oxford: Oxford UP, 2007. Print. p70. ISBN 9780841239272
- ^ Garrett, Reginald H.; Grisham, Charles M. (2013). Biochemistry (5th ed. ed.). Belmont, CA: Brooks/Cole, Cengage Learning. p. 108. ISBN 9781133106296
- ^ Garrett, Reginald H.; Grisham, Charles M. (2013). Biochemistry (5th ed. ed.). Belmont, CA: Brooks/Cole, Cengage Learning. p. 108. ISBN 9781133106296
- ^ Garrett, Reginald H.; Grisham, Charles M. (2013). Biochemistry (5th ed. ed.). Belmont, CA: Brooks/Cole, Cengage Learning. p. 108. ISBN 9781133106296
- ^ Garrett, Reginald H.; Grisham, Charles M. (2013). Biochemistry (5th ed. ed.). Belmont, CA: Brooks/Cole, Cengage Learning. p. 108. ISBN 9781133106296
Konten ini disalin dari wikipedia, mohon digunakan dengan bijak.
