Supergrup (biologi)
Supergrup, dalam sistematika, adalah sekelompok besar organisme yang memiliki satu nenek moyang yang sama dan memiliki ciri-ciri penentu yang penting. Ini merupakan peringkat taksonomi biologis yang bersifat informal dan cenderung arbitrer, yang sering kali lebih tinggi dari filum atau kerajaan, meskipun beberapa supergrup juga diperlakukan sebagai filum.[1]
Supergrup eukariotik
Sejak dekade 2000-an, pohon kehidupan eukariotik (disingkat eToL) telah dibagi menjadi 5–8 pengelompokan utama yang disebut 'supergrup'. Pengelompokan ini dibentuk berdasarkan gagasan bahwa hanya kelompok monofiletik yang harus diterima sebagai peringkat, sebagai alternatif dari penggunaan kerajaan parafiletik, Protista.[2] Pada masa-masa awal eToL, enam supergrup tradisional dipertimbangkan: Amoebozoa, Opisthokonta, "Excavata", Archaeplastida, "Chromalveolata", dan Rhizaria. Sejak saat itu, eToL telah mengalami penataan ulang yang mendalam, dan sebagian besar kelompok ini ternyata parafiletik atau tidak memiliki ciri morfologis penentu yang menyatukan anggotanya, yang membuat label 'supergrup' menjadi lebih arbitrer.[1]
Saat ini, penambahan banyak garis keturunan protista yang baru ditemukan (seperti Telonemia, Picozoa, Hemimastigophora, Rigifilida...) dan penggunaan analisis filogenomik telah menghasilkan model supergrup baru yang lebih akurat. Berikut adalah supergrup eukariota yang diakui saat ini:[1]
- TSAR, terdiri dari Telonemia dan klade SAR (Stramenopila, Alveolata, dan Rhizaria).[3] Kelompok ini diperkirakan mencakup hingga separuh dari seluruh keanekaragaman eukariotik, karena mencakup berbagai kelompok besar seperti diatom, dinoflagelata, rumput laut, siliata, foraminifera, radiolaria, serta parasit apicomplexa dan oomycete.[1] Pada dasarnya, kelompok ini mencakup sebagian besar "Chromalveolata".
- Haptista (diperingkatkan sebagai filum), sebelumnya termasuk dalam "Chromalveolata", mencakup alga haptophyta dan centrohelid.
- Cryptista (diperingkatkan sebagai filum), sebelumnya termasuk dalam "Chromalveolata", mencakup kriptomonad, katablefarid, dan Palpitomonas yang enigmatis.
- Archaeplastida (juga diperlakukan sebagai kerajaan), terdiri dari garis keturunan yang memperoleh kloroplas melalui endosimbiosis primer: Kloroplastida (alga hijau dan tumbuhan darat), Rodofita, Glaukofita, dan Rhodelphis.
- Amorphea, terdiri dari Amoebozoa dan Opisthokonta (hewan, jamur, dan protista terkait). Mereka berkerabat dengan breviate dan apusomonad, dan bersama-sama membentuk klade Obazoa.
- CRuMs, terdiri dari kelompok protozoa hidup bebas Collodictyonidae, Rigifilida, dan Mantamonas.
- Discoba, terdiri dari Discicristata (Euglenozoa dan Heterolobosea), Jakobida, dan Tsukubamonas. Ini adalah klade terbesar yang tersisa dari "Excavata".
- Metamonada, (diperingkatkan sebagai filum) sebelumnya merupakan bagian dari "Excavata", seluruhnya berisi protista anaerobik.
- Hemimastigophora, (diperingkatkan sebagai filum) sebelumnya merupakan klade yatim (orphan clade) tetapi baru-baru ini dimasukkan ke dalam Diaphoretickes.[4]
- Provora, supergrup terbaru, yang berisi Ancoracysta yang sebelumnya yatim.[4]
Banyak kelompok yatim protozoa hidup bebas yang masih tertinggal, tidak dapat dimasukkan ke dalam supergrup mana pun, seperti: Picozoa (kemungkinan termasuk dalam Archaeplastida dengan kepastian terbatas), Malawimonadida (dianggap berkerabat dengan Metamonada), Ancyromonadida, Breviatea, Apusomonadida, dll.[1]
Kemungkinan topologi modern eToL adalah sebagai berikut (supergrup ditandai dengan huruf tebal):[4][5]
Supergrup prokariotik
Istilah 'supergrup' digunakan dalam studi filogenetik bakteri, dalam arti yang lebih sempit dibandingkan pada eukariota. Pada tahun 2021, istilah ini sangat umum digunakan untuk menamai klade dalam genus Wolbachia.[6][7][8]
Referensi
- ^ a b c d e Burki F, Roger AJ, Brown MW, Simpson AGB (Januari 2020). "The New Tree of Eukaryotes". Trends Ecol Evol. 35 (1): 43–55. doi:10.1016/j.tree.2019.08.008. PMID 31606140.
- ^ Simpson, Alastair G.B.; Roger, Andrew J. (2004). "The real 'kingdoms' of eukaryotes". Current Biology. 14 (17): R693 – R696. doi:10.1016/j.cub.2004.08.038. PMID 15341755. S2CID 207051421.
- ^ Strassert JFH, Jamy M, Mylnikov AP, Tikhonenkov DV, Burki F (April 2019). "New Phylogenomic Analysis of the Enigmatic Phylum Telonemia Further Resolves the Eukaryote Tree of Life". Molecular Biology and Evolution. 36 (4): 757–765. doi:10.1093/molbev/msz012. PMC 6844682.
- ^ a b c Tikhonenkov, Denis V.; Mikhailov, Kirill V.; Gawryluk, Ryan M. R.; Belyaev, Artem O.; Mathur, Varsha; Karpov, Sergey A.; Zagumyonnyi, Dmitry G.; Borodina, Anastasia S.; Prokina, Kristina I.; Mylnikov, Alexander P.; Aleoshin, Vladimir V.; Keeling, Patrick J. (2022). "Microbial predators form a new supergroup of eukaryotes". Nature. doi:10.1038/s41586-022-05511-5. PMID 36477531.
- ^ Brown MW, et al. (2018), "Phylogenomics Places Orphan Protistan Lineages in a Novel Eukaryotic Super-Group", Genome Biology and Evolution, 10 (2): 427–433, doi:10.1093/gbe/evy014, PMC 5793813
- ^ Baldo L, Werren JH (2007). "Revisiting Wolbachia Supergroup Typing Based on WSP: Spurious Lineages and Discordance with MLST". Curr Microbiol. 55: 81–87. doi:10.1007/s00284-007-0055-8.
- ^ Konecka, Edyta; Olszanowski, Ziemowit (2021). "Wolbachia supergroup E found in Hypochthonius rufulus (Acari: Oribatida) in Poland". Infection, Genetics and Evolution. 91 (104829). doi:10.1016/j.meegid.2021.104829. ISSN 1567-1348.
- ^ Covacin C, Barker SC (2007). "Supergroup F Wolbachia bacteria parasitise lice (Insecta: Phthiraptera)". Parasitol Res. 100: 479–485. doi:10.1007/s00436-006-0309-6.
Konten ini disalin dari wikipedia, mohon digunakan dengan bijak.
