Pangkalan Data Klasifikasi Struktural Protein (bahasa Inggris: Structural Classification of Proteins/ SCOP) adalah pangkalan data klasifikasi struktural protein berdasarkan data yang terdapat dalam Bank Data Protein.^[3] Dalam basis data ini, protein dikelompokkan berdasarkan hubungan struktural dan evolusioner. Protein dengan bentuk yang sama tetapi memiliki sedikit kesamaan urutan atau fungsi ditempatkan dalam superfamili yang berbeda, dan diasumsikan hanya memiliki nenek moyang bersama yang sangat jauh. Protein yang memiliki bentuk yang sama dan beberapa kesamaan urutan dan/atau fungsi ditempatkan dalam "famili", dan diasumsikan memiliki nenek moyang bersama yang lebih dekat.

SCOP di Pusat Rekayasa Protein dan Laboratorium Biologi Molekuler di Cambridge, Inggris.^[4] Dari 1994 hingga 2010, pangkalan data ini oleh Alexey G. Murzin dan rekan-rekannya di Pusat Rekayasa Protein. Setelah tahun 2010, mereka mengembangkan pangkalan data ini di Laboratorium Biologi Molekuler.^[5][6][7][1] Namun SCOP 1.75 telah dihentikan pada tahun 2014, sehingga tim SCOPe dari Universtas California, Berkeley bertanggung jawab untuk memperbarui basis data dengan cara yang kompatibel, dengan kombinasi metode otomatis dan manual. Rilis terbaru pada April 2019 adalah SCOPe 2.07 (Maret 2018).^[2]

Saat ini, terdapat SCOP2 yang merupakan perbaharuan dari SCOP dalam kategori pengelompokan protein serta penampilan hubungan evolusioner antar protein.^[3] Pembaruan terbaru yang dilakukan pada tahun 2020 ini menampilkan skema basis data yang disempurnakan, API baru, dan antarmuka web yang dimodernisasi, sehingga merupakan pembaruan paling signifikan yang dilakukan oleh tim Cambridge sejak SCOP 1.75 dan dibangun di atas kemajuan skema dari prototipe SCOP 2.^[8]

1. ^ ^{a b} Andreeva A, Howorth D, Chandonia JM, Brenner SE, Hubbard TJ, Chothia C, Murzin AG (January 2008). "Data growth and its impact on the SCOP database: new developments". Nucleic Acids Research. 36 (Database issue): D419-25. doi:10.1093/nar/gkm993. PMC 2238974. PMID 18000004.
2. ^ ^{a b} Chandonia JM, Fox NK, Brenner SE (January 2019). "SCOPe: classification of large macromolecular structures in the structural classification of proteins-extended database". Nucleic Acids Research. 47 (D1): D475 – D481. doi:10.1093/nar/gky1134. PMC 6323910. PMID 30500919.
3. ^ ^{a b} Aprilyanto, Victor; Sembiring, Langkah (2017). Bioinformatika. Yogyakarta: Innosain. ISBN 9786026542328. Pemeliharaan CS1: Status URL (link)
4. ^ Murzin AG, Brenner SE, Hubbard T, Chothia C (April 1995). "SCOP: a structural classification of proteins database for the investigation of sequences and structures". Journal of Molecular Biology. 247 (4): 536–40. doi:10.1016/S0022-2836(05)80134-2. PMID 7723011.
5. ^ Hubbard TJ, Ailey B, Brenner SE, Murzin AG, Chothia C (January 1999). "SCOP: a Structural Classification of Proteins database". Nucleic Acids Research. 27 (1): 254–6. doi:10.1093/nar/27.1.254. PMC 148149. PMID 9847194.
6. ^ Lo Conte L, Ailey B, Hubbard TJ, Brenner SE, Murzin AG, Chothia C (January 2000). "SCOP: a structural classification of proteins database". Nucleic Acids Research. 28 (1): 257–9. doi:10.1093/nar/28.1.257. PMC 102479. PMID 10592240.
7. ^ Andreeva A, Howorth D, Brenner SE, Hubbard TJ, Chothia C, Murzin AG (January 2004). "SCOP database in 2004: refinements integrate structure and sequence family data". Nucleic Acids Research. 32 (Database issue): D226-9. doi:10.1093/nar/gkh039. PMC 308773. PMID 14681400.
8. ^ Andreeva A, Kulesha E, Gough J, Murzin AG (January 2020). "SCOP database in 2020:: expanded classification of representative family and superfamily domains of known protein structures". Nucleic Acids Research. 48 (Database issue): D376 – D382. doi:10.1093/nar/gkz1064. PMC 7139981. PMID 31724711.