Kromosom 5

Kromosom 5
Pasangan kromosom 5 manusia setelah pemitaan G. Satu dari ibu, dan satu dari ayah.
Pasangan kromosom 5
dalam kariogram manusia laki-laki
Ciri
Panjang (bp)182,045,439 bp
(CHM13)
No. gen839 (CCDS)[1]
JenisAutosom
Posisi sentromerSubmetasentris[2]
(48.8 Mbp[3])
Daftar gen lengkap
CCDSDaftar gen
HGNCDaftar gen
UniProtDaftar gen
NCBIDaftar gen
Penampil peta eksternal
EnsemblChromosome 5
EntrezChromosome 5
NCBIChromosome 5
UCSCChromosome 5
Urutan DNA lengkap
RefSeqNC_000005 (FASTA)
GenBankCM000667 (FASTA)

Kromosom 5 adalah salah satu dari 23 pasang kromosom pada manusia. Umumnya manusia memiliki dua salinan dari kromosom ini. Kromosom 5 membentang sepanjang 182 juta pasangan basa (bahan pembangun DNA), serta mewakili hampir 6% dari total DNA dalam sel. Kromosom 5 adalah kromosom manusia terbesar ke-5, tetapi memiliki salah satu kepadatan gen yang paling rendah. Hal ini sebagian dijelaskan karena banyaknya wilayah yang miskin-gen, yang menunjukkan tingkat konservasi sintenik dan non-penyandi dengan vertebrata non-mamalia, menyarankan bahwa mereka terbatas secara fungsional.

Karena kromosom 5 bertanggungjawab atas banyak wujud perubahan-perubahan pertumbuhan dan perkembangan (pembelahan sel), perubahan dalam kromosom ini dapat menyebabkan kanker. Contohnya adalah leukemia mieloid akut (acute myeloid leukemia, AML).[4]

Jumlah gen

Berikut adalah estimasi jumlah gen untuk kromosom manusia 1. Karena ahli-ahli menggunakan pendekatan-pendekatan yang berbeda untuk menganotasikan genom, perkiraan-perkiraan jumlah gen pada setiap kromosom berbeda. Di antara proyek-proyek lainnya, Proyek Pengurutan Koding Konsensus Kolaboratif (CCDS) menggunakan sebuah strategi yang sangat konservatif. Oleh karena itu, prediksi jumlah gen oleh CCDS mewakili batas ambang bawah untuk jumlah total gen-gen penyandi-protein manusia.[5]

Diperkirakan oleh Gen penyandi protein Gen RNA non-penyandi Pseudogen Sumber Tanggal terbit
CCDS 839 [1] 2016-09-08
HGNC 790 355 574 [6] 2017-05-12
Ensembl 882 1,207 707 [7] 2017-03-29
UniProt 875 [8] 2018-02-28
NCBI 886 981 785 [9][10][11] 2017-05-19

Referensi

  1. ^ a b "Search results - 5[CHR] AND "Homo sapiens"[Organism] AND ("has ccds"[Properties] AND alive[prop]) - Gene". NCBI. CCDS Release 20 for Homo sapiens. 2016-09-08. Diakses tanggal 2017-05-28.
  2. ^ Tom Strachan; Andrew Read (2 April 2010). Human Molecular Genetics. Garland Science. hlm. 45. ISBN 978-1-136-84407-2.
  3. ^ Genome Decoration Page, NCBI. Ideogram data for Homo sapience (850 bphs, Assembly GRCh38.p3). Last update 2014-06-03. Retrieved 2017-04-26.
  4. ^ "Chromosome 5". Genetics Home Reference. Lister Hill National Center for Biomedical Communications. U.S. National Library of Medicine. December 2014.
  5. ^ Pertea M, Salzberg SL (2010). "Between a chicken and a grape: estimating the number of human genes". Genome Biol. 11 (5): 206. doi:10.1186/gb-2010-11-5-206. PMC 2898077. PMID 20441615.
  6. ^ "Statistics & Downloads for chromosome 5". HUGO Gene Nomenclature Committee. 2017-05-12. Diarsipkan dari asli tanggal 2017-06-29. Diakses tanggal 2017-05-19.
  7. ^ "Chromosome 5: Chromosome summary - Homo sapiens". Ensembl Release 88. 2017-03-29. Diakses tanggal 2017-05-19.
  8. ^ "Human chromosome 5: entries, gene names and cross-references to MIM". UniProt. 2018-02-28. Diakses tanggal 2018-03-16.
  9. ^ "Search results - 5[CHR] AND "Homo sapiens"[Organism] AND ("genetype protein coding"[Properties] AND alive[prop]) - Gene". NCBI. 2017-05-19. Diakses tanggal 2017-05-20.
  10. ^ "Search results - 5[CHR] AND "Homo sapiens"[Organism] AND ( ("genetype miscrna"[Properties] OR "genetype ncrna"[Properties] OR "genetype rrna"[Properties] OR "genetype trna"[Properties] OR "genetype scrna"[Properties] OR "genetype snrna"[Properties] OR "genetype snorna"[Properties]) NOT "genetype protein coding"[Properties] AND alive[prop]) - Gene". NCBI. 2017-05-19. Diakses tanggal 2017-05-20.
  11. ^ "Search results - 5[CHR] AND "Homo sapiens"[Organism] AND ("genetype pseudo"[Properties] AND alive[prop]) - Gene". NCBI. 2017-05-19. Diakses tanggal 2017-05-20.

Konten ini disalin dari wikipedia, mohon digunakan dengan bijak.

×
Advertisement