Copa Airlines melayani 49 destinasi di 29 negara pada Juni 2011:^[1]

Untuk destinasi Aero República lihat Destinasi maskapai Copa Airlines Colombia.

• Aruba
  • Oranjestad – Bandar Udara Internasional Queen Beatrix
• Bahamas
  • Nassau – Bandar Udara Internasional Lynden Pindling
• Kuba
  • Havana – Bandar Udara Internasional José Martí
• Republik Dominika
  • Punta Cana – Bandar Udara Internasional Punta Cana
  • Santiago de los Caballeros – Bandar Udara Internasional Cibao
  • Santo Domingo – Bandar Udara Internasional Las Américas
• Haiti
  • Port-au-Prince – Bandar Udara Internasional Port-au-Prince
• Jamaika
  • Kingston – Bandar Udara Internasional Norman Manley
• Puerto Riko
  • San Juan – Bandar Udara Internasional Luis Muñoz Marín
• Sint Maarten
  • Philipsburg, Sint Maarten – Bandar Udara Internasional Putri Juliana
• Trinidad dan Tobago
  • Port of Spain – Bandar Udara Internasional Piarco

• Kosta Rika
  • San José, Kosta Rika – Bandar Udara Internasional Juan Santamaria (kota fokus)
• El Salvador
  • San Salvador - Bandar Udara Internasional Cuscatlan
• Guatemala
  • Guatemala City – Bandar Udara Internasional La Aurora
• Honduras
  • San Pedro Sula – Bandar Udara Internasional Ramón Villeda Morales
  • Tegucigalpa – Bandar Udara Internasional Toncontín
• Nikaragua
  • Managua – Bandar Udara Internasional Augusto C. Sandino (kota fokus)
• Panama
  • Panama City – Bandar Udara Internasional Tocumen (hub)

• Kanada
  • Toronto – Bandar Udara Internasional Pearson Toronto
• Meksiko
  • Cancun – Bandar Udara Internasional Cancún
  • Guadalajara – Bandar Udara Internasional Don Miguel Hidalgo y Costilla
  • Mexico City – Bandar Udara Internasional Mexico City
• Amerika Serikat
  • Los Angeles – Bandar Udara Internasional Los Angeles
  • Miami – Bandar Udara Internasional Miami
  • New York City – Bandar Udara Internasional John F. Kennedy
  • Orlando – Bandar Udara Internasional Orlando
  • Washington, D.C. – Bandar Udara Internasional Washington Dulles

• Argentina
  • Buenos Aires – Bandar Udara Internasional Ministro Pistarini
  • Córdoba – Bandar Udara Internasional Ingeniero Ambrosio L.V. Taravella
• Bolivia
  • Santa Cruz de la Sierra – Bandar Udara Internasional Viru Viru
• Brazil
  • Belo Horizonte – Bandar Udara Internasional Tancredo Neves
  • Manaus – Bandar Udara Internasional Eduardo Gomes
  • Porto Alegre – Bandar Udara Internasional Salgado Filho
  • Rio de Janeiro – Bandar Udara Internasional Rio de Janeiro-Galeão
  • São Paulo – Bandar Udara Internasional São Paulo-Guarulhos
• Chili
  • Santiago, Chili – Bandar Udara Internasional Comodoro Arturo Merino Benítez
• Kolombia
  • Barranquilla – Bandar Udara Internasional Ernesto Cortissoz
  • Bucaramanga – Bandar Udara Internasional Palonegro dioperasikan oleh Copa Airlines Colombia
  • Bogotá – Bandar Udara Internasional El Dorado
  • Cali – Bandar Udara Internasional Alfonso Bonilla Aragón dioperasikan oleh Copa Airlines Colombia
  • Cartagena – Bandar Udara Internasional Rafael Núñez
  • Medellín – Bandar Udara Internasional José María Córdova
  • Pereira – Bandar Udara Internasional Matecaña dioperasikan oleh Copa Airlines Colombia
  • San Andrés – Bandar Udara Internasional Gustavo Rojas Pinilla
• Ekuador
  • Guayaquil – Bandar Udara Internasional José Joaquín de Olmedo
  • Quito – Bandar Udara Internasional Mariscal Sucre
• Peru
  • Lima – Bandar Udara Internasional Jorge Chavez
• Uruguay
  • Montevideo – Bandar Udara Internasional Carrasco
• Venezuela
  • Caracas – Bandar Udara Internasional Simón Bolívar
  • Maracaibo – Bandar Udara Internasional La Chinita
  • Valencia – Bandar Udara Internasional Arturo Michelena