Berikut Daftar transfer pemain sepak bola Indonesia 2016. Hanya meliputi pergerakan bursa transfer klub Indonesia Soccer Championship A dan Indonesia Soccer Championship B.

Tanggal	Nama	Pindah dari	Pindah ke	Biaya
02016-06-2626 Juni 2016[1]	Boman Irie Aimé	PSM Makassar	Dipecat
02016-06-2626 Juni 2016[1]	Lamine Diarrassouba	PSM Makassar	Dipecat
02016-06-2626 Juni 2016[1]	Alex da Silva de Souza	PSM Makassar	Dipecat
02016-06-2626 Juni 2016[1]	Paulo César Silva Martins	PSM Makassar	Dipecat
02016-07-1414 Juli 2016[2]	Kwon Jun	Tampines Rovers	PSM Makassar
02016-07-1414 Juli 2016[2]	Wiljan Pluim	Becamex Bình Dương	PSM Makassar
02016-07-1414 Juli 2016[2]	Ronald Hikspoors	Sarawak FA	PSM Makassar
02016-07-1414 Juli 2016[2]	Luiz Ricardo	Botafogo	PSM Makassar